| Titre : | Analyse des relations structures- propriétés dans des nouvelles céphalosporines et oxazoles par la modélisation moléculaire |
| Auteurs : | Malika Mellaoui, Auteur ; salah Belaidi, Directeur de thèse |
| Type de document : | Monographie imprimée |
| Editeur : | Biskra [Algerie] : Université Mohamed Kheider, 2009 |
| Format : | 104 p / 30 cm |
| Accompagnement : | CD |
| Langues: | Français |
| Langues originales: | Français |
| Mots-clés: | céphalosporine,oxazole,antibiotique,hydrophobe,hydrophile,modélisation moléculaire,relation structure-activité. السيفالسبرين، الأ جززول، المضاد الحيوي،كاره للماء ،محب للماء،الامتثال ،العلاقة بنية فعالية. |
| Résumé : |
nouvelles céphalosporines antibiotiques etdes nouveaux oxazoles antibiotiques.Il est basé surla modélisation moléculaire (QSAR,mécanique moléculaire et dynamique moléculaire ,PM3 et AB initio ). La comparaison structurale et électronique pour un exemple type de céphalosporine ou d’un exemple type d’oxazole présente des résultas similaire entre (MM); (PM3) et AB initio. Dans les céphalosporines mono ubstituées le composé (3), methyl-3céphalosporine est le plus actif chimiquement, et le C3 est préféré pour subir une attaque électrophile, Dans les céphalosporines disubstitués, le composé (11) diméthyl-3, 4 céphalosporine est le plus actif chimiquement et le carbone C3 est préféré pour subir une attaque électrophile, Les composés de l’oxazole : le composé (4), methyl-5 et le composé (6), dimethyl 2-5 s’avèrent plus réactifs. Pour la série de céphalosporine le céfapirine et la céfalotine présente le coefficient de partage (Log P)le plus bas (-3.30 -2.79 respectivement). Pour la série d’oxazole le composé 9 et le composé 10 présentes le coefficient de partage (Log P) le plus bas (-3.41, -3.01 respectivement).Il se traduit par une meilleure tolérance gastrique.
׃ العمل الحا لي يدخل في ﺇطا ر بحث أساسي حول العلا قة بنية فعا لية للمضادات الحيو ية السيفا لسبرينية والأجززولية و هو يعتمد أساسا على اﻟﻧﻤﺫجة الجز ئية (RASQ، الميكانيكا و الدينامبكا الجز ئية، MP3، Ab initio) المقارنة الهيكلية والألكترونية من أجل السيفالسبرين والأ جززول تقدم نتائج مماثلة بين مختلف الطرق MM ‘3MP وAb initio. في السيفالسبرينيات أحادية اﻹستبدال،المركب(3)، مثيل3-سيفالسبرين هوالأكثر نشاطا كيميائيا،والكربون(3) هو المفضل ﻹجراء هجوم قطب مشحون . في السيفالسبرينيا ثنائية اﻹستبدال،المركب(11)، ديمثيل3،4- سيفالسبرين هو الأكثر نشاطا كيميائيا، والكربون(3)هو المفضل ﻹجراء هجوم قطب مشحون،من أجل الأجززول، المركب(4) مثيل-5 والمركب(6)، )، ديمثيل2،5هما الأكثر نشاطا كيميائيا.من أجل سلسلة السيفالسبرين،السيفبيرين والسيفا لوتين يظهران قيم معامل الفصل الأقل (3.30 - و-2.79 – على الترتيب ) من أجل سلسلة الأ جززول المركب(9) و المركب(10) يظهران قيم معامل الفصل الأقل (3.41 - و-3.01 – على الترتيب ) .و اﻟذﻱ يفسر أن لهما تقبلا معويا افضل |
| Sommaire : |
INTRODUCTION GENERALE 1
CHAPITRE І : Généralités sur les macrolides antibiotiques 6 I-1.Generalites sur les maladies infectieuses. 7 I-2.Rappel sur les maladies infectieuses 9 І-2-1.Introcuction 9 І-2-2.Définition 9 І-2-3.Utilusations des antibiotiques 10 І-2-4.pharmacocinétique des antibiotiques 11 І-2-4-1.Résorptoin 11 І-2-4-2.Diffusion 11 І-2-4-3.Elimination 11 І-2-4-4.Transformation in vivo 12 І-2-5.Classification des antibiotiques 12 І-2-6.pharmacodynamique des antibiotiques 13 І-2-7.Résistance bactérienne aux antibiotiques 14 І-2-7-1.comment une bactérie devient-elle résistante ?14 І-2-7-2.Résistanc naturelle.15 І-2-7-3. Résistance acquise 15 I-2-7-4. Mécanisme de résistance 15 I-3. Céphalosporines antibiotiques 17 I-3-1. Introduction 17 I-3-2. Structure chimique 19 I-3-3. Sources et utilisations 19 I-3-4.Mode d'action et spectre d'activité 20 1-3-5.Classification des céphalosporines 20 I-3-6. Pharmacocinétique des céphalosporines 21 I-3-6-1. Absorption 21 I-3-6-2. Distribution 22 I-3-6-3. Elimination 22 I-3-7. Des exemples d’étude des céphalosporines 22 I-3-7-1.Céfuroxime axetil 22 I-3-7-1-1.Définition 22 I-3-7-1-2.Présentation 22 I-3-7-1-3 .Mécanisme d’action 23 I-3-7-1-4.Propriétés pharmacocinétiques 23 I-3-7-1-5 : Indications Thérapeutiques 24 I-3-7-1-6. Contre-indications 24 I-3-7-1-7.Posologie et mode d'administration 24 Ι-4.Oxazole 25 Ι-4-1 : Introduction 25 Ι-4-2.Définition 25 Ι-4-3.Définition et généralités sur les aromes 25 Ι-4-4.Antifongiques 26 Ι-4-5.Des exemples d’étude des oxazoles antibiotiques 26 Ι-4-5-1. Linozolide 26 Ι-4-5-1. Définition 26 Ι-4-5-2.Mécanisme d’action 27 Ι-4-5-3.pharmacocinétique 27 Ι-5.Références 29 CHAPITRE П : Modelisation moléculaire II-1.Description de la méthode 32 II-1-1. Introduction 32 II-1-2. Base de la chimie quantique 32 II-1-2-1. Equation de Schrödinger 32 II-1-2-2. Hamiltonien moléculaire 33 II-1-2-3. Fonction d'onde électronique 35 II-1-3.Comparaison sommaire des différentes méthodes.35 II-2.Reprsentation des méthodes de calcule 36 II-2-1. Mécanique moléculaire 36 II-2-1-1. Introduction 37 II-2-1-2. Energie d’élongation 38 II-2-1-3. Energie de flexion 38 II-2-1-1-4. Energie de torsion 39 II-2-1-1-5. Energie de Van der Waals 40 II-2-1-1-6. Energie électrostatique 41 II-2-1-1-7. Adjonction de termes croisés 42 II-2-2. Dynamique moléculaire 43 II-2-2-1. Introduction 43 II-2-2-2Principes de la dynamique moléculaire 43 II-2-2-1-3. Applications de la dynamique moléculaire 46 II-2-3. Simulations de Monte Carlo 46 II-2-3-1. Introduction 46 II-2-3-2. principes de base des simulations de Monte Carlo 47 II-2-3-3. Analyse conformationnelle par la Monte Carlo 48 II-2-3-4. Quelques Applications de la Monte Carlo 49 II-2-4. Méthode quantique : Ab initio 49 II-2-4-1. Méthode Hartree-Fock 50 II-2-4-2. Méthode post-Hartree-Fock 51 II-2-4-3. Théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT)52 II-2-5. Méthodes semi-empiriques 53 II-2-5-1.Introduction 53 II-2-5-2. Méthode semi-empirique (CNDO 53 II-2-5-3. méthode semi-empirique (PM3) 54 II-2-6. Méthodes de corrélation quantitative (QSAR)55 II-2-6-1. Introduction 55 II-2-6-2.Volume et surface moléculaire 56 II-2-6-3. L’énergie d’hydratation 56 II-2-6-4. Paramètre de lipophilie 57 II-2-6-5. Polarisabilité 58 II-2-6-6. Paramètres associés à la topologie 1D 59 II-3.Methode de recherche des Minima 59 II-3-1. Introduction 59 II-3-2. Algorithmes de minimisation 60 II-3-2-1. La méthode de "steepest descent"61 II-3-2-2. La méthode du gradient conjugué 61 II-3-2-3. La méthode Newton-Raphson.62 II-3-2-4. La méthode du recuit simulé 62 II-4.Domaine d’aplication de modelisation moléculaire 63 II-4-1. Introduction 63 II-4-2. Etude de structures 64 II-4-3. Interprétation de la réactivité 64 II-4-4. Analyse conformationnelle 64 II-5.Granddeurs derives de l’energie sterique 66 II-5-1. Enthalpie de formation 66 II-5-2. Energie de tension 66 II-6.Limitation de la modélisation moléculaire 67 II-7.Programmes utilises et materiels 68 II-8.Références 69 CHAPITRE ПI : Analyse conformationnelle des céphalosporines antibiotiques et l’oxazole III-1-1. Comparaison structurale et électronique des noyaux de base 72 III-1-1-1.Etude du noyau de base de la céphalosporine 72 III-1-1-2. Etude de l’oxazole 75 III-2-1.Etude de l’effet du substituant sur le squelette de base de céphalosporine et l’oxazole 78 III-2-1-1.Introduction 78 III-2 -1-2 : substitution du noyau de base des céphalosporines 79 III-2 -1-3 : substitution de noyau de l’oxazole 84 III-3. Conclusion 89 III-4.Références 91 CHAPITRE IV :Etude de la relation structure –activité dans les cèphalosporines antibiotiques et l’oxzole antibiotique. IV-1.Modellation des conformations des Céphalosporines et des Oxazoles à une interface hydrophobe / hydrophyle IV-1-1. Introduction générale 93 IV-1-2.comparaison structurale des deux sériées étudié 93 IV-1-2-1.la sériée des céphalosporines 93 IV-1-2-2 la sériée des oxazoles 96 IV-1-3-1. Etude des paramètres amphiphiliques 98 IV-1-3-2.Etude des paramètres QSAR des céphalosporines antibiotiques 98 IV-1-3-3.Etude des paramètres QSAR des oxazoles antibiotiques 100 IV-2.Conclusion 102 IV-3.Références 103 CONCLUSION GENERALE 104 |
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